Всё согласно описанию: https://git.zabbix.com/projects/ZBX/repos/zabbix/browse/templates/db/mysql_agent
За исключением необходимости создания домашнего каталога для пользователя zabbix, т.к. при установке из репозитория ubuntu, домашний каталог и соответствющая переменная не создаются.

mkdir -p /var/lib/zabbix
usermod -d /var/lib/zabbix zabbix